Når de ikke er i felten, laver museets arkæologer både små og store forskningsprojekter.  Den arkæologiske forskning foregår med udgangspunkt i de mange spændende udgravningsresultater fra Thy og Mors med forskning i bebyggelsessystemer, lokalsamfund m.m. igennem forhistorien og tidlig historisk tid.  

For øjeblikket er arkæologernes forskning især koncentreret om yngre bronzealder og ældre jernalder. Et projekt udforsker de mange spændende aspekter af Kallerupfundet mens en række mindre projekter gør arkæologiske lokaliteter klar til publicering. Hvis du vil vide mere om museets arkæologiske forskning, kan du læse om den i forskningsstrategien her.

Ved siden af forskningsprojekterne arbejder arkæologerne også med formidlingspublikationer til den brede offentlighed og med udviklingsprojekter, der skal gøre det daglige arbejde med administration og udgravninger mere effektivt. Her et det især registreringen af nu overpløjede gravhøje og agersystemer fra gamle kort og luftfotos der har krævet en del arbejde. 

I 2025 er arkæologerne ind imellem alt det andet arbejde gået i gang med en bog til den brede offentlighed. Den skal skrive (for)historien om Thy belyst igennem de mest ikoniske fund. Med fund så forskellige som bueskyttegrave fra bondestenalder, guldarmringe og deres fjerne forbindelser fra bronzealderen og de hjemlige byhøje med begravede mennesker i fra jernalderen kommer bogen vidt omkring, samtidigt med, at den er bundet op på lokaliteterne i Thy.